Kapselskaller fremstillet af naturlige materialer udviser god biologisk nedbrydelighed og biokompatibilitet, som let nedbrydes i tarmene uden at udgøre en sundhedsfare. Disse skaller har dog dårlig syre- og alkaliresistens og varmebestandighed, hvilket gør dem uegnede til høje-temperaturer, høj-fugtighed og sure/alkaliske miljøer.
Kapselskaller fremstillet af kemisk syntetiserede eller semi-syntetiske materialer har god syre- og alkaliresistens, høj-temperaturbestandighed, høj-fugtighedsbestandighed og varme-forseglingsegenskaber, hvilket muliggør deres anvendelse i en bredere vifte af anvendelser. Imidlertid er biokompatibiliteten og bionedbrydeligheden af disse materialer ikke blevet fuldt verificeret.
